É um exame imprescindível para se determinar o melhor tratamento. Por meio deste, analisam-se, na amostra inicial e na amostra após preparo/capacitação em meios de cultura específicos, através de técnicas recentes e aparelhagens laboratoriais modernas, a concentração de espermatozóides no sêmen, sua mobilidade, morfologia, sua carga genética e nuclear.

Além dessa análise, o Instituto Brasileiro de Reprodução Assistida também oferece técnicas mais especializadas no diagnóstico da infertilidade masculina, como a pesquisa de anticorpos antiespermatozóides, fragmentação nuclear e outros.