A infertilidade masculina se deve a fatores internos e externos.

 Infecções e inflamações
As vesículas seminais e a próstata são responsáveis a produção de substâncias essenciais a vitalidade dos espermatozóides. Infecções e inflamações dessas glândulas alteram significativamente a vitalidade desses gametas, interferindo diretamente na capacidade de fecundar o gameta feminino. Além disso, as infecções e inflamações podem também obstruir os canais que transportam os espermatozóides e o próprio líquido seminal ao sistema genital feminino e podem atuar diretamente nos testículos alterando a formação dos gametas masculinos.

 Alterações hormonais
Predisposição genética, tumores, medicamentos, tabagismo podem alterar o equilíbrio hormonal masculino, interferindo na gametogênese – formação dos gametas masculinos com reflexos direto sobre a fertilidade.

 Quantidade e qualidade dos espermatozóides
Diminuição da quantidade, assim como alterações da qualidade – motilidade, morfologia, carga nuclear são responsáveis por 90% dos casos de infertilidade masculina.

 Varicocele
Trata-se da formação de varizes nas veias da região escrotal, onde estão alojados os testículos. As dilatações dessas veias prejudicam o fluxo sanguíneo local, a troca de nutrientes e levam ao acúmulo de substâncias tóxicas e ao aumento de temperatura. Esses fatores produzem alteração direta nos espermatozóides e trabalhos atuais demonstram também uma relação dos portadores de varicocele com alteração cromossômica.

 Distúrbios imunológicos
Qualquer alteração no perfil imunológico do homem pode alterar a integridade dos seus gametas como também interferir na capacidade funcional desses gametas.